📊 Estructura del dataset
🔹 Variables
biopsia_cancer→ Gold standard
- 1 = cáncer confirmado (biopsia)
- 0 = no cáncer
tc_torax→ Prueba diagnóstica (TC de tórax)
- 1 = sospechoso/positivo
- 0 = negativo
🧠 Contexto clínico (para el ejercicio)
Se evalúa el rendimiento diagnóstico de la tomografía de tórax para detectar cáncer pulmonar, utilizando la biopsia como estándar de referencia.
🔬 Características del dataset
✔ Prevalencia ≈ 25% (realista en población de riesgo)
✔ Sensibilidad alta (~90%)
✔ Especificidad moderada (~75%)👉 Simula bien un escenario clínico:
- buena prueba de screening
- no perfecta para confirmación
🔹 Comando
🔹 Interpretación
📊 1. Tabla 2×2 (base del análisis)
| Cáncer (+) | Cáncer (–) | Total | |
|---|---|---|---|
| TC + | 100 (VP) | 69 (FP) | 169 |
| TC – | 10 (FN) | 221 (VN) | 231 |
| Total | 110 | 290 | 400 |
📈 2. Métricas principales
🔹 Prevalencia
- 42.3%
👉 Alta (población seleccionada de riesgo)
🔹 Sensibilidad
- 59.2%
👉 Interpretación:
La TC detecta ~6 de cada 10 pacientes con cáncer.
⚠️ Moderada → no ideal para screening
🔹 Especificidad
- 95.7%
👉 Interpretación:
La TC identifica correctamente a los no enfermos en ~96%.
✔ Muy alta → buena para confirmación
🎯 3. Valores predictivos
🔹 VPP
- 90.9%
👉 Si la TC es positiva:
91% probabilidad de tener cáncer
✔ Muy alto (influido por prevalencia)
🔹 VPN
- 76.2%
👉 Si la TC es negativa:
76% probabilidad de no tener cáncer
⚠️ No descarta completamente
🔬 4. Razones de verosimilitud
🔹 LR+
- 13.67
👉 Interpretación:
Una TC positiva aumenta fuertemente la probabilidad de cáncer
✔ Muy buena (>10) → útil para confirmar
🔹 LR−
- 0.43
👉 Interpretación:
Reduce algo la probabilidad, pero no suficiente
⚠️ No descarta enfermedad
📊 5. AUC (ROC)
- 0.77
👉 Interpretación:
| AUC | Interpretación |
|---|---|
| 0.7–0.8 | Aceptable |
🧠 6. Integración clínica
🔴 Perfil de la prueba
| Característica | Evaluación |
|---|---|
| Sensibilidad | Moderada ❗ |
| Especificidad | Alta ✔ |
| LR+ | Excelente ✔ |
| LR− | Limitado ❗ |
| AUC | Aceptable |
Evaluación de la probabilidad post-prueba de cáncer pulmonar mediante el nomograma de Fagan a partir de tomografía de tórax
🔴 Escenario 1: Test positivo (TC +)
Resultado
- Probabilidad post-test ≈ 84%
Interpretación clínica
Un resultado positivo en la tomografía incrementa la probabilidad de cáncer pulmonar de 27.5% a ~84%.
Implicación
- Aumento grande del riesgo (salto diagnóstico)
- Alta probabilidad de enfermedad → valor confirmatorio
Conducta
- Confirmar con biopsia (gold standard)
- Iniciar ruta diagnóstica/terapéutica oncológica
Mensaje clave
La TC positiva es útil para confirmar cáncer pulmonar.
🔵 Escenario 2: Test negativo (TC −)
Resultado
- Probabilidad post-test ≈ 13.9%
Interpretación clínica
Un resultado negativo reduce la probabilidad de cáncer de 27.5% a ~14%.
Implicación
- Reducción moderada del riesgo
- Persisten casos no detectados (FN) → no descarta
Conducta
- Si baja sospecha clínica: seguimiento
- Si alta sospecha: continuar estudio (p. ej., PET-CT, repetición de imagen, biopsia)
Mensaje clave
La TC negativa no excluye cáncer pulmonar.
📊 Resumen comparativo
| Escenario | Probabilidad |
|---|---|
| Pre-test | 27.5% |
| Post-test (+) | ~84% |
| Post-test (−) | ~13.9% |
🧠 Conclusión integradora
La tomografía de tórax presenta alta utilidad para confirmar cáncer pulmonar (LR+ alto), pero capacidad limitada para descartarlo (LR− moderado). Su uso óptimo es como prueba confirmatoria, no de tamizaje.
